Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabra3P26049 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra3P26049 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra3P26049 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabra3P26049 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra3P26049 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra3P26049 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms