Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnnc1P19123 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnc1P19123 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnc1P19123 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnnc1P19123 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms