Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RargP18911 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RargP18911 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RargP18911 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RargP18911 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RargP18911 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RargP18911 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RargP18911 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RargP18911 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RargP18911 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RargP18911 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RargP18911 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RargP18911 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RargP18911 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RargP18911 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RargP18911 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RargP18911 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RargP18911 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RargP18911 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RargP18911 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RargP18911 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RargP18911 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RargP18911 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RargP18911 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RargP18911 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RargP18911 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RargP18911 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RargP18911 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RargP18911 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RargP18911 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RargP18911 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RargP18911 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RargP18911 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RargP18911 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RargP18911 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RargP18911 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RargP18911 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RargP18911 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RargP18911 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RargP18911 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RargP18911 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RargP18911 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RargP18911 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RargP18911 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RargP18911 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RargP18911 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RargP18911 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RargP18911 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RargP18911 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RargP18911 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RargP18911 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RargP18911 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RargP18911 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RargP18911 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RargP18911 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RargP18911 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RargP18911 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RargP18911 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RargP18911 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RargP18911 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RargP18911 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RargP18911 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RargP18911 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RargP18911 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RargP18911 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RargP18911 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RargP18911 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RargP18911 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RargP18911 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RargP18911 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RargP18911 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RargP18911 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RargP18911 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RargP18911 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RargP18911 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms