Protein–RNA interactions for Protein: P17879

Hspa1b, Heat shock 70 kDa protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa1bP17879 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa1bP17879 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa1bP17879 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa1bP17879 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa1bP17879 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa1bP17879 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspa1bP17879 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspa1bP17879 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspa1bP17879 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspa1bP17879 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms