Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DmdP11531 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DmdP11531 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DmdP11531 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DmdP11531 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DmdP11531 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DmdP11531 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DmdP11531 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DmdP11531 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DmdP11531 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DmdP11531 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DmdP11531 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DmdP11531 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DmdP11531 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DmdP11531 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DmdP11531 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DmdP11531 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DmdP11531 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DmdP11531 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DmdP11531 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DmdP11531 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DmdP11531 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DmdP11531 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DmdP11531 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DmdP11531 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DmdP11531 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DmdP11531 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DmdP11531 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DmdP11531 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DmdP11531 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DmdP11531 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DmdP11531 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DmdP11531 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DmdP11531 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DmdP11531 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DmdP11531 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DmdP11531 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DmdP11531 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DmdP11531 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DmdP11531 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DmdP11531 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DmdP11531 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DmdP11531 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DmdP11531 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DmdP11531 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DmdP11531 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DmdP11531 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DmdP11531 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DmdP11531 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DmdP11531 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DmdP11531 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DmdP11531 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DmdP11531 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DmdP11531 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DmdP11531 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
DmdP11531 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DmdP11531 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DmdP11531 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DmdP11531 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DmdP11531 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DmdP11531 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DmdP11531 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DmdP11531 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DmdP11531 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DmdP11531 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DmdP11531 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DmdP11531 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DmdP11531 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DmdP11531 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DmdP11531 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DmdP11531 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DmdP11531 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DmdP11531 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DmdP11531 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DmdP11531 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DmdP11531 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DmdP11531 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DmdP11531 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DmdP11531 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DmdP11531 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DmdP11531 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DmdP11531 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DmdP11531 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DmdP11531 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DmdP11531 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DmdP11531 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DmdP11531 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DmdP11531 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DmdP11531 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DmdP11531 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DmdP11531 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DmdP11531 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DmdP11531 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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