Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Surf1P09925 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Surf1P09925 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf1P09925 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf1P09925 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Surf1P09925 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Surf1P09925 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Surf1P09925 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Surf1P09925 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Surf1P09925 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf1P09925 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf1P09925 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf1P09925 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Surf1P09925 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Surf1P09925 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Surf1P09925 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf1P09925 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf1P09925 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Surf1P09925 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Surf1P09925 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Surf1P09925 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Surf1P09925 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf1P09925 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms