Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh1P09803 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh1P09803 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh1P09803 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh1P09803 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh1P09803 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh1P09803 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh1P09803 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh1P09803 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms