Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gap43P06837 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gap43P06837 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gap43P06837 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gap43P06837 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gap43P06837 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gap43P06837 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms