Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt1P04104 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt1P04104 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt1P04104 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt1P04104 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt1P04104 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt1P04104 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt1P04104 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt1P04104 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt1P04104 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt1P04104 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt1P04104 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt1P04104 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms