Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Setdb1O88974 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Setdb1O88974 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Setdb1O88974 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Setdb1O88974 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setdb1O88974 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setdb1O88974 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms