Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shoc2O88520 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shoc2O88520 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shoc2O88520 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shoc2O88520 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shoc2O88520 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shoc2O88520 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shoc2O88520 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shoc2O88520 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shoc2O88520 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms