Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp8O70404 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp8O70404 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp8O70404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms