Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppargc1aO70343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppargc1aO70343 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1aO70343 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppargc1aO70343 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1aO70343 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppargc1aO70343 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms