Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lnx1O70263 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lnx1O70263 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lnx1O70263 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lnx1O70263 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lnx1O70263 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lnx1O70263 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lnx1O70263 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms