Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl35aO55142 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl35aO55142 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35aO55142 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl35aO55142 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms