Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxO54751 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxO54751 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxO54751 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxO54751 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxO54751 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxO54751 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxO54751 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxO54751 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxO54751 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxO54751 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxO54751 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxO54751 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxO54751 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CrxO54751 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CrxO54751 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CrxO54751 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CrxO54751 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CrxO54751 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CrxO54751 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CrxO54751 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CrxO54751 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CrxO54751 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CrxO54751 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CrxO54751 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CrxO54751 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CrxO54751 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CrxO54751 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CrxO54751 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CrxO54751 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CrxO54751 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CrxO54751 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CrxO54751 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CrxO54751 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CrxO54751 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CrxO54751 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CrxO54751 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CrxO54751 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CrxO54751 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CrxO54751 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CrxO54751 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CrxO54751 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CrxO54751 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CrxO54751 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CrxO54751 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CrxO54751 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxO54751 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxO54751 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxO54751 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CrxO54751 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CrxO54751 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CrxO54751 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxO54751 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CrxO54751 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CrxO54751 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms