Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn9O35239 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn9O35239 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn9O35239 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn9O35239 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpn9O35239 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn9O35239 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms