Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf11O35235 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf11O35235 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf11O35235 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms