Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpaO35216 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpaO35216 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpaO35216 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpaO35216 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpaO35216 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpaO35216 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CenpaO35216 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpaO35216 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CenpaO35216 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpaO35216 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpaO35216 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpaO35216 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpaO35216 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpaO35216 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpaO35216 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpaO35216 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpaO35216 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CenpaO35216 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpaO35216 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpaO35216 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpaO35216 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpaO35216 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpaO35216 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpaO35216 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpaO35216 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms