Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scarb2O35114 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scarb2O35114 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarb2O35114 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarb2O35114 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms