Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ArxO35085 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ArxO35085 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ArxO35085 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ArxO35085 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ArxO35085 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ArxO35085 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ArxO35085 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ArxO35085 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ArxO35085 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ArxO35085 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ArxO35085 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ArxO35085 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ArxO35085 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ArxO35085 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ArxO35085 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ArxO35085 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ArxO35085 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ArxO35085 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ArxO35085 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ArxO35085 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ArxO35085 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArxO35085 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArxO35085 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArxO35085 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ArxO35085 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ArxO35085 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ArxO35085 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ArxO35085 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ArxO35085 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ArxO35085 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ArxO35085 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ArxO35085 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ArxO35085 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ArxO35085 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ArxO35085 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ArxO35085 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ArxO35085 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArxO35085 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArxO35085 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArxO35085 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ArxO35085 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ArxO35085 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ArxO35085 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ArxO35085 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ArxO35085 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ArxO35085 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ArxO35085 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ArxO35085 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ArxO35085 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ArxO35085 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ArxO35085 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ArxO35085 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ArxO35085 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ArxO35085 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ArxO35085 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ArxO35085 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ArxO35085 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ArxO35085 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ArxO35085 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ArxO35085 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ArxO35085 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ArxO35085 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ArxO35085 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ArxO35085 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ArxO35085 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArxO35085 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArxO35085 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ArxO35085 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ArxO35085 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ArxO35085 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ArxO35085 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ArxO35085 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArxO35085 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArxO35085 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ArxO35085 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ArxO35085 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ArxO35085 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ArxO35085 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ArxO35085 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ArxO35085 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ArxO35085 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ArxO35085 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ArxO35085 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ArxO35085 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ArxO35085 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ArxO35085 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms