Protein–RNA interactions for Protein: O09164

Sod3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod3O09164 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sod3O09164 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sod3O09164 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sod3O09164 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sod3O09164 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sod3O09164 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sod3O09164 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sod3O09164 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sod3O09164 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sod3O09164 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sod3O09164 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sod3O09164 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sod3O09164 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sod3O09164 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms