Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb6O08644 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ephb6O08644 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb6O08644 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb6O08644 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb6O08644 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ephb6O08644 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms