Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna3O08545 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna3O08545 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna3O08545 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna3O08545 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna3O08545 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna3O08545 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Efna3O08545 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna3O08545 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna3O08545 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna3O08545 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna3O08545 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna3O08545 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna3O08545 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna3O08545 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna3O08545 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna3O08545 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna3O08545 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna3O08545 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna3O08545 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna3O08545 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna3O08545 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efna3O08545 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Efna3O08545 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna3O08545 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna3O08545 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna3O08545 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna3O08545 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna3O08545 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna3O08545 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms