Protein–RNA interactions for Protein: J3QMB3

Fam240b, Family with sequence similarity 240 member B, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240bJ3QMB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240bJ3QMB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240bJ3QMB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240bJ3QMB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam240bJ3QMB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms