Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp994J3QM38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp994J3QM38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp994J3QM38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp994J3QM38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms