Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tubgcp6G5E8P0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tubgcp6G5E8P0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tubgcp6G5E8P0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tubgcp6G5E8P0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tubgcp6G5E8P0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Tubgcp6G5E8P0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tubgcp6G5E8P0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tubgcp6G5E8P0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms