Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4cG3UXD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4cG3UXD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Speer4cG3UXD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer4cG3UXD1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Speer4cG3UXD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms