Protein–RNA interactions for Protein: G3UWA8

C130060K24Rik, RIKEN cDNA C130060K24, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130060K24RikG3UWA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C130060K24RikG3UWA8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C130060K24RikG3UWA8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C130060K24RikG3UWA8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C130060K24RikG3UWA8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C130060K24RikG3UWA8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.8 ms