Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srp72F8VQC1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srp72F8VQC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp72F8VQC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp72F8VQC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms