Protein–RNA interactions for Protein: F6YNI8

Gm21319, Predicted gene, 21319, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21319F6YNI8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm21319F6YNI8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21319F6YNI8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21319F6YNI8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm21319F6YNI8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21319F6YNI8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21319F6YNI8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21319F6YNI8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21319F6YNI8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms