Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc74aE9Q9U8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc74aE9Q9U8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms