Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3hdm1E9Q9Q2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3hdm1E9Q9Q2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3hdm1E9Q9Q2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3hdm1E9Q9Q2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R3hdm1E9Q9Q2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms