Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6K3

Pibf1, Progesterone immunomodulatory-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pibf1E9Q6K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pibf1E9Q6K3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pibf1E9Q6K3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pibf1E9Q6K3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pibf1E9Q6K3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pibf1E9Q6K3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pibf1E9Q6K3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms