Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms