Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc171E9Q1U1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc171E9Q1U1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc171E9Q1U1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc171E9Q1U1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc171E9Q1U1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc171E9Q1U1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc171E9Q1U1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
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