Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28043E0CXC2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm28043E0CXC2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28043E0CXC2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28043E0CXC2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28043E0CXC2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms