Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim12cD3Z3L3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim12cD3Z3L3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12cD3Z3L3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim12cD3Z3L3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim12cD3Z3L3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim12cD3Z3L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim12cD3Z3L3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim12cD3Z3L3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim12cD3Z3L3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms