Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slfn8B1ARD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slfn8B1ARD8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn8B1ARD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn8B1ARD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms