Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc38A2VDH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc38A2VDH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc38A2VDH3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc38A2VDH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc38A2VDH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc38A2VDH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms