Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem185aA2AF53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem185aA2AF53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem185aA2AF53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem185aA2AF53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms