Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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