Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms