Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28576A0A087WRP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28576A0A087WRP6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28576A0A087WRP6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28576A0A087WRP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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