Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms