Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDGFDQ9GZP0 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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