Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMG1Q96Q15 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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