Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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FAM3DQ96BQ1 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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FAM3DQ96BQ1 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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FAM3DQ96BQ1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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FAM3DQ96BQ1 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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FAM3DQ96BQ1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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FAM3DQ96BQ1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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FAM3DQ96BQ1 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM3DQ96BQ1 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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