Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CLPPQ16740 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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