Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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