Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZNF239Q16600 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZNF239Q16600 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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ZNF239Q16600 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF239Q16600 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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